期刊简介

               本刊创刊于1984年9月,是中华人民共和国卫生部主管,中国卫生信息学会(原中国卫生统计学会)和中国医科大学主办的全国性卫生统计专业学术性双月刊,是国内卫生统计专业的唯一学术性期刊和中国医学类中文核心期刊及国家科技部中国科技论文统计源期刊。本刊的任务是及时报道我国卫生统计学科的科研成果和卫生统计工作改革与卫生事业发展的信息。主要读者对象为各级卫生机构的卫生统计人员、卫生技术人员和高等医学院校卫生统计专业的教学和科研人员。                

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  • 杂志名称:中国卫生统计杂志
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国卫生信息学会 中国医科大学
  • 国际刊号:1002-3674
  • 国内刊号:21-1153/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录:北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 维普收录(中)
中国卫生统计杂志2017年第03期

SKAT与惩罚回归模型两阶段策略在基因组关联研究中的应用

张俊国;林志丰;刘丽;李丽霞;杨翌;郜艳晖

关键词:SKAT, 惩罚回归模型, 基因组关联研究
摘要:目的 本研究提出两阶段分析策略,将SKAT与惩罚回归模型联合应用,为遗传关联研究提供方法学选择的依据和指导.方法 本研究使用遗传分析工作组18的数据,分别采用SKAT,LASSO,EN,cMCP,Gel以及两阶段统计分析策略(SKAT+EN,SKAT+LASSO,EN+SKAT,LASSO+SKAT)进行关联性分析.结果 在基因水平,SKAT法的平均灵敏度与约登指数高.除SKAT法外,其余统计策略的关联基因选出率均与对结局方差解释的比例和基因中包含SNPs的数目存在关联.在SNPs水平,EN法与EN+SKAT的灵敏度与约登指数高.不同的统计策略均能把对结局效应贡献大的真关联基因MAP4与SNPs筛选出来.结论 SKAT和EN联合分析策略能够在数百万SNPs中筛选主要的疾病关联基因与SNPs,并在基因水平上统计推断,有着较高灵敏度,同时还能控制严重的假阳性错误,为遗传关联研究提供了一种较为高效的统计分析策略.