期刊简介

               本刊创刊于1984年9月,是中华人民共和国卫生部主管,中国卫生信息学会(原中国卫生统计学会)和中国医科大学主办的全国性卫生统计专业学术性双月刊,是国内卫生统计专业的唯一学术性期刊和中国医学类中文核心期刊及国家科技部中国科技论文统计源期刊。本刊的任务是及时报道我国卫生统计学科的科研成果和卫生统计工作改革与卫生事业发展的信息。主要读者对象为各级卫生机构的卫生统计人员、卫生技术人员和高等医学院校卫生统计专业的教学和科研人员。                

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  • 杂志名称:中国卫生统计杂志
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国卫生信息学会 中国医科大学
  • 国际刊号:1002-3674
  • 国内刊号:21-1153/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录:北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 维普收录(中)
中国卫生统计杂志2016年第06期

基因表达谱的非参缺失森林填补算法研究

吴小姣;李高明;易大莉;刘岭;张彦琦;易东;伍亚舟

关键词:基因表达谱, 缺失数据, 缺失森林法, 聚类
摘要:目的 评估不同基因表达谱数据集下,多种算法在缺失数据中的填补效果,并分析其对无监督基因表达谱聚类的影响.方法 在不同缺失比例的情况下,分别采用非参缺失森林填补法、贝叶斯线性回归法、蒙特卡洛多重填补法和K邻近填补法进行填补,通过均方根误差(NRMSE)和聚类准确率(F值)两个指标来评估不同方法的填补效能和聚类效果,并用模拟数据集进行测试和乳腺癌数据集进行验证.结果 随着缺失比例的增加,四种填补方法的NRMSE都逐渐上升;任意缺失比例下,相比于其他三种方法非参缺失森林填补法的填补优势明显.缺失比例为5%、10%、20%和30%的乳腺癌数据集,非参缺失森林填补法的NRMSE依次为0.1951 (95% CI,0.1945~0.1953)、0.2776 (95% CI,0.2783~2791)、0.4003 (95% CI,0.3986 ~0.4002)和0.4974(95%CI,0.4658~0.5104);聚类效果的准确率为1.0、0.91、0.88和0.82.结论 非参缺失森林填补算法实现简单,对数据集的要求较低,比传统填补算法具有更好的稳定性和精确度,可保留较多的基因信息供后续的功能聚类等分析.