期刊简介
本刊创刊于1984年9月，是中华人民共和国卫生部主管，中国卫生信息学会(原中国卫生统计学会)和中国医科大学主办的全国性卫生统计专业学术性双月刊，是国内卫生统计专业的唯一学术性期刊和中国医学类中文核心期刊及国家科技部中国科技论文统计源期刊。本刊的任务是及时报道我国卫生统计学科的科研成果和卫生统计工作改革与卫生事业发展的信息。主要读者对象为各级卫生机构的卫生统计人员、卫生技术人员和高等医学院校卫生统计专业的教学和科研人员。
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首页>中国卫生统计杂志
- 杂志名称：中国卫生统计杂志
- 主管单位：中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位：中国卫生信息学会 中国医科大学
- 国际刊号：1002-3674
- 国内刊号：21-1153/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录：北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 维普收录(中)
使用肺癌GWAS数据进行遗传风险预测的方法和策略研究
段巍巍；赵杨；张丽伟；胡志斌；陈峰
关键词：肺癌, 遗传风险得分, 支持向量机, 随机森林, 最优预测子集, 单核苷酸多态性
摘要：目的 探讨基于肺癌全基因组关联研究数据的遗传风险预测方法和策略.方法 将肺癌GWAS数据中的南京子样本和北京子样本分别作为训练集和测试集,分别使用预测全集和优预测子集两种策略,比较三种预测方法在不同连锁不平衡结构(UD)和初筛检验水准(α)下的预测准确度.结果 wGRS在高LD结构下,随着-log (α)增大,预测准确度呈现上升趋势;RF和SVM对LD结构不如wGRS敏感,但三种方法在低LD结构(r2<0.2)下预测准确度优于高LD结构;wGRS方法下优预测子集效果略优于预测全集效果,SVM下子集效果与全集近似,但略逊于全集,RF下子集效果则不如全集,且差距较大.结论 基于LD结构修剪SNP位点和选择适当的初筛水准可以提高遗传风险预测准确度,此时wGRS方法预测效果优于SVM和RF.
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