期刊简介

               本刊创刊于1984年9月,是中华人民共和国卫生部主管,中国卫生信息学会(原中国卫生统计学会)和中国医科大学主办的全国性卫生统计专业学术性双月刊,是国内卫生统计专业的唯一学术性期刊和中国医学类中文核心期刊及国家科技部中国科技论文统计源期刊。本刊的任务是及时报道我国卫生统计学科的科研成果和卫生统计工作改革与卫生事业发展的信息。主要读者对象为各级卫生机构的卫生统计人员、卫生技术人员和高等医学院校卫生统计专业的教学和科研人员。                

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  • 杂志名称:中国卫生统计杂志
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国卫生信息学会 中国医科大学
  • 国际刊号:1002-3674
  • 国内刊号:21-1153/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录:北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 维普收录(中)
中国卫生统计杂志2009年第03期

六种基因表达谱数据筛选差异表达基因方法的比较

李运明;曹文君;陈长生

关键词:基因表达谱, 基因组信息学, SAM, 多重检验, FWER, FDR, pFDR
摘要:目的 比较SAM方法、Bonferroni校正法、BH法等6种基因表达谱数据筛选差异表达基因的方法,探讨了各种方法的筛选效果.方法 采用6种待比较的方法处理不同样本量和方差条件下的模拟数据,比较筛选结果与模拟设定的差异,计算相应的考核指标,探讨6种方法筛选差异表达基因的效果.结果 Bonferroni校正法、Sidak校正法和Hochberg法可将FWER、FDR控制在很低的水平,但是筛选出的差异表达基因数比较少;成组t检验方法筛选的差异表达基因数多,但是不能有效地控制FWER、FDR水平,筛选出的差异表达基因假阳性数过多;相同样本量和方差条件下,SAM方法和BH法筛选差异表达基因数、假阳性数、FWER和FDR均相差不大,均筛选出较多的差异表达基因,且控制了多重检验错误率.结论 SAM方法适用于基因表达谱数据筛选差异表达基因的数据分析.