期刊简介

               本刊创刊于1984年9月,是中华人民共和国卫生部主管,中国卫生信息学会(原中国卫生统计学会)和中国医科大学主办的全国性卫生统计专业学术性双月刊,是国内卫生统计专业的唯一学术性期刊和中国医学类中文核心期刊及国家科技部中国科技论文统计源期刊。本刊的任务是及时报道我国卫生统计学科的科研成果和卫生统计工作改革与卫生事业发展的信息。主要读者对象为各级卫生机构的卫生统计人员、卫生技术人员和高等医学院校卫生统计专业的教学和科研人员。                

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  • 杂志名称:中国卫生统计杂志
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国卫生信息学会 中国医科大学
  • 国际刊号:1002-3674
  • 国内刊号:21-1153/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录:北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 维普收录(中)
中国卫生统计杂志2009年第05期

两种基因集分析方法的有效性比较

曹文君;李运明;陈长生

关键词:基因表达谱, 基因集, SAM-GS, χ2-Fisher's精确检验, 推断
摘要:目的 比较竞争性原假设χ~2-Fisher's精确概率法和自限性原假设SAM-GS方法作为基因集分析方法筛选富集基因集的效能,探讨两种方法的筛选效果.方法 采用两种待比较的方法处理5种不同情景下的模拟数据,比较筛选结果与模拟设定的差异,计算相应的评价指标,探讨两种方法筛选富集基因集的效果.结果 相同设定条件下,SAM-GS方法的筛选率均高于χ~2-Fisher's精确概率法.但推断结论相差不大,即当两组间均数相差较小(≤0.30)时,两种方法均不能较好地识别组间差异;相反,当两组均数差异足够大(>0.30)时,两种方法均能识别差异.结论 SAM-GS方法略优于χ~2-Fisher's精确概率法,但两种方法均可用于基因表达谱筛选富集基因集的分析.χ~2-Fisher's精确概率法的优点是可用来分析解释变量为多分类变量的数据资料.